1. 皮膚：八成的病人會出現手指腫脹，皮膚緊繃而且變厚，呈現硬皮狀態，當天氣變冷或情緒緊張時，血管收縮造成血流循環下降，引起手指、腳趾末端出現紫黑色的雷諾氏徵象（指當遇冷環境時四肢蒼白、冰冷甚至發黑）；有四成病人臉部會出現皮疹，眼瞼下變淡紫色，指甲周圍、臉部毛細血管擴張，少部份皮膚顏色變淡或變黑（深）。
2. 肌肉關節：八到九成的病人肌肉受侵犯，近端肌肉常有壓痛或肌肉無力；一百人中有約七十五人會有類似風濕性關節炎的關節病變。
3. 腸胃道：約五成病人會出現胃食道逆流並伴隨胃灼熱和吞嚥困難。
4. 心臟、肺臟：約有四成病人出現心包炎、心包積液、二尖瓣脫垂、心肌炎、動脈粥樣硬化（指血管受到脂肪堆積造成硬化）。七成病人肺部會受到侵犯，出現胸腔積液、間質性肺疾病（指會造成肺部實質發炎、浸潤的疾病） 及肺動脈高壓（肺動脈壓力正常值大約在18~25毫米汞柱，肺動脈壓力在休息狀態時高於25毫米汞柱，即為「肺動脈高壓」）等，最常見的症狀是呼吸困難。
5. 神經：約有兩成五的病人有神經系統異常，可能有頭痛、癲癇、周邊神經病變等，其中以三叉神經痛最常見。
6. 腎臟：較少侵犯腎臟，合併類固醇治療，效果佳且預後良好。
   

有上述症狀不一定是混合性結締組織疾病，若您有上述症狀，請至過敏免疫風濕科門診就醫。

1. 有類風濕性關節炎表現，會使用非類固醇類止痛藥物或免疫調節藥物治療。
2. 皮膚損傷情形，會用Plaquenil(奎寧)治療，若發生關節炎、皮疹、漿膜炎（肋膜或心包膜發炎，會有胸痛的症狀）、肌炎、貧血、白血球下降、腎炎，會使用類固醇治療，一般而言類固醇對此疾病之關節炎、皮疹、漿膜炎、肌炎、貧血、白血球下降及腎炎有良好反應。
3. 腎臟受到侵犯時，除了使用類固醇外，還會合併細胞毒性藥物治療，如Endoxan(癌得星)、CellCept(山喜多)或Myfortic(睦體康)等藥物治療。